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NGS분석서비스

Characteristic

NGS서비스는 동물, 식물, 박테리아 등 다양한 생물체로부터 게놈 DNA를 시퀀싱하는 빠르고 비용 효율적인 분석 방법입니다. NGS는 DNA 분자를 여러 조각으로 나누는 대용량 시퀀싱 방법을 사용하여 수억 개의 DNA 분자를 한 번에 시퀀싱 할 수 있습니다.

Service Process

연계 물류 네트워크를 활용하여 전국의 연구실에서 준비되는 시료를 신속하고 안전하게 분석기술연구소로 이송, 차질없이 NGS분석이 진행될 수 있도록 시료 운반 서비스를 제공하고 있습니다.

특히 지방의 경우, 시료의 안정성을 위해 당일 운반을 원칙으로 하고 있습니다.
(오전에 시료 준비 완료 및 수거, 오후에 분석기술연구소 도착)

 

 

 

  

Metagenome Sequencing

16S rRNA amplicon sequencing

미생물의 대표적인 바이오마커인 16S rRNA gene의 variable region 염기서열 분석을 통해,

해당 미생물 군집의 종류를 추정하는 마이크로바이옴 분석법입니다. (Genus level Analysis)

 

Shotgun metagenome sequencing

특정 환경에서 분리한 모든 유전체 DNA(metagenome)의 염기서열을 분석하는 마이크로바이옴 분석법입니다.

방대한 양의 유전 정보를 분석하기 때문에 미생물의 조성 뿐만 아니라 이들의 유전자까지 모두 확인이 가능합니다.

(Species level Analysis)

 

 Item

 16S rRNA amplicon sequencing

Shotgun metagenome sequencing 

 Platform format

 Illumina MiSeq,2x300

 Illumina NextSeq2000, 2x150

 

 

 



 

Whole-Genome Sequencing

Bacterial genome sequencing

박테리아의 전장 유전체 (whole genome) 염기서열 정보를 밝혀내고, 유전체 상에 존재하는 유전자의 위치와 그 기능을 예측할 수 있습니다.

또한 비교 유전체 분석 등의 추가 분석을 통해, 각 미생물이 가진 생물학적 특징을 매우 상세하게 알아낼 수 있습니다.

 

- De-novo sequencing : 아직 염기서열이 해독되지 않은 생명체의 염기서열을 NGS로 분석하여 genome을 구축하고자 할 때 사용하는 분석

- Re-sequencing : 이미 reference genome이 완성된 생물종의 다양한 유전체를 분석하고 그 서열을 reference sequence와 비교함으로써,특정 유전체 내 SNP 등의 변이를 발굴하고자 할 때 사용하는 분석

 

Hybrid whole genome sequencing

Illumina & ONT 플랫폼을 동시에 사용하여 기존에 상용화된 long read sequencer와 동일한 Quality의 complete genome sequencing을 합리적인 가격으로 수행합니다.

 

 Data Generation

 Short-Read Sequencing

 Long-Read Sequencing

 Platform format

 Illumina MiSeq, 2x300

 ONT GridlON

  

Transcriptome Sequencing

Bacterial gene expression profiling

일정 조건에서 발현되는 mRNA를 추출 후, 이들의 염기서열만을 분석하는 유전자 발현 분석법입니다.

특정 순간에 활성화된 박테리아의 유전자 정보를 알아내고 이를 정량화 및 구조적, 기능적으로 분석하려 어느 유전자가 더 많이 혹은 더 적게 발현되었는지 확인합니다.

 

 Application

 mRNA Sequencing

 Total RNA Sequencing

 Format

 2x150

 2x150

 Library type

 Truseq Standard mRNA Library

Truseq Standard Total RNA Library

(with Ribo-zero)